Als msi sehe ich da keine Schnelllösung. Allerdings habe ich für den normalen Innosetup-Installer einen Parameter gefunden, mit dem Du das lösen könntest:
Fc_Setup.exe /DIR="D:\Programme\freeCommander2006" /NOICONS /VERYSILENT /NORESTART
Das ganze müsste dann als Startup-Skript über die GPO gesteuert werden. Mit einer CMD kannst Du ja auch prüfen, ob der freeCommander bereits im Verzeichnis "D:\Programme\freeCommander2006" liegt und davon dann die Installation abhängig machen.
ungefähr:
If exist %Pfad%\freeCommander.exe Goto Abbruch
:InstallationFC
echo Installiere freeCommander...
"\\server\Freigabe\Fc_Setup.exe" /DIR="D:\Programme\freeCommander2006" /NOICONS /VERYSILENT /NORESTART
:Abbruch
exit
Ende der Datei.
Mehr Parameter zum Innosetup habe ich hier gefunden:
Installing WinEdt
Bitte beachte, dass ich dies nicht getestet habe und es nur um eine Anregung geht, Dein problem zu lösen.
Gruß,
Puffy64