Späte Antwort:
Die Vollversion von AVG hat sehr wohl einen Rootkitscanner. Und Gmer ist ein Tool, das helfen kann, wenn man ein Rootkit sucht - kein Onlinescanner.
Gmer verträgt sich durchaus mit Virenscannern - nur macht das keinen Sinn. Wenn ich ein Rootkit suche, dann mach ich alles aus, was die Suche erschweren kann, auch den Virenscanner (Kiste vom netz nehmen).
Und: Gmer, Icesword und Co. sind mächtige Werkzeuge. Man sollte wissen, was man tut. Ein unüberlegter Klick und Dein System ist nur noch Schrott.