Ich mache es so:
mit Nero bootbare CD auswählen, im Diskettenlaufwerk habe ich eine Startdiskette, wähle die Daten aus, die mit auf die CD sollen, fertig.
Nero holt sich die Bootinformationen von der Diskette, auf der CD siehst Du davon hinterher nichts mehr, dort erscheinen nur die Daten.